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做Western Blot 时,我们需要考虑到抗体能不能识别目标蛋白、是否适用于样本物种,以及能否在WB 的变性条件下稳定识别目标条带。
确认目标蛋白名称👉亚型和修饰位点👉样本物种👉查看是否明确适用于WB,👉根据蛋白丰度选择单克隆或多克隆抗体👉结合内参、一抗宿主和二抗体系完成搭配。
总结起来,WB一抗选择主要看六点:
靶点是否准确、样本物种是否匹配、是否经过WB验证、单抗或多抗是否适合、宿主能否与检测体系配套、灵敏度是否符合蛋白丰度。
同一个蛋白可能存在多个名称或亚型,例如p53 也可写作 TP53;AKT 又可分为 AKT1、AKT2、AKT3。如果研究对象是某个特定亚型,就要确认抗体识别的是总 AKT,还是只识别其中一种亚型。
如果检测的是磷酸化蛋白,还要进一步明确修饰位点。例如:
总AKT 与 p-AKT 不是同一种检测目标;
p-AKT Ser473 与 p-AKT Thr308 也不能混用;
检测磷酸化蛋白时,通常还要同时检测对应的总蛋白。
此外,建议提前查询目标蛋白的理论分子量,用于判断条带是否出现在合理位置。但实际条带可能受到剪切、糖基化、磷酸化或聚合状态影响,不能只根据理论分子量下结论。
一抗宿主选取与样本不同种属(小鼠样本-兔源一抗),减少交叉反应。
抗体说明中的Reactivity,表示这支抗体能够识别哪些物种来源的目标蛋白,例如Human、Mouse、Rat、Rabbit。
假设实验样本来自大鼠,就要确认抗体对Rat 具有反应性;样本来自人源细胞,就要确认其覆盖 Human。
样本物种不等于抗体宿主(Host Species)。“兔抗人蛋白”表示抗体由兔产生,但检测的是人源目标蛋白。兔源抗体并不是只能检测兔样本,鼠源抗体也不是只能检测小鼠样本。
跨物种使用时,还要考虑目标蛋白在不同物种间的序列同源性。如果抗体没有明确验证目标物种,即使理论上可能识别,还是要先做预实验确认。
一支抗体适合免疫组化或免疫荧光,不代表它一定适合Western Blot。
WB 中的蛋白通常经过 SDS、还原剂和高温处理,蛋白结构已经发生变性。有些抗体识别的是天然构象表位,在 IF 或 IHC 中效果很好,但到了 WB 中可能完全没有条带。
因此,选择时要重点确认应用范围中明确包含:WB 或 Western Blot。
❌ 如果只标注了IHC、IF、IP,而没有 WB,不建议直接用于正式实验。
单克隆抗体只识别一个抗原表位,通常特异性较好、背景较干净,批次稳定性也相对更高,适合:
定量WB;
磷酸化位点检测;
同源蛋白较多的靶点;
对特异性要求较高的实验。
但单抗只识别一个表位,如果该表位被修饰、遮挡或破坏,可能出现识别不到的情况。
多克隆抗体可以识别目标蛋白上的多个表位,通常灵敏度较高,对蛋白结构变化的容忍度更好,适合:
低丰度蛋白;
初步筛查;
目标蛋白表位容易发生变化的情况。
它的不足是更容易出现杂带,批次之间也可能存在一定差异。
所以,单抗和多抗没有绝对的好坏。常规定量实验可优先考虑特异性稳定的单克隆抗体;目标蛋白丰度较低时,可考虑高质量多克隆抗体。
兔源抗体通常亲和力和灵敏度较高,比较适合低丰度蛋白检测;鼠源抗体种类多、应用成熟,很多常见蛋白都有稳定的鼠单抗。
但宿主选择不能只看“谁的信号更强”,还要考虑整套检测方案。
例如,目标蛋白一抗是兔源,内参一抗是鼠源,就可以分别使用抗兔二抗和抗鼠二抗,更方便区分。如果目标蛋白和内参都使用兔源一抗,同时孵育时就容易被同一种二抗识别。
因此,选择一抗宿主时,要提前考虑:
是否要同时检测目标蛋白和内参;
是否进行双色荧光检测;
是否需要多重WB;
实验室现有二抗能否匹配。
不同蛋白的表达丰度差异很大。
GAPDH、β-actin 等高丰度蛋白,高灵敏度反而容易出现信号过强、条带饱和。
对于转录因子、膜蛋白、磷酸化蛋白等中低丰度目标,应优先考虑亲和力较高、验证较充分的一抗,并结合样本类型适当优化上样量和孵育条件。
如果目标蛋白极低丰度,仅靠增加一抗浓度不一定有效,还要考虑蛋白提取效率、上样量、转膜条件和显色系统。