对于科研人员来说，查文献、整理文献、写论文几乎贯穿整个科研过程。

刚开始接触科研时，很多人都会遇到类似的问题：

下载了一堆 PDF 文件，文件名混乱，想找某篇关键文献时半天找不到；

看过的文章没有记录，过几个月再回头看，已经忘记文章讲了什么；

写论文需要引用参考文献时，一个个手动输入，不仅耗费时间，还容易出现格式错误。

尤其是在论文投稿阶段，不同期刊对参考文献格式要求不同，如果完全依靠人工调整，往往需要花费大量时间。

这时候，一款优秀的文献管理工具就非常重要。

Zotero 作为目前科研人员常用的免费文献管理软件，可以帮助科研人员完成文献收集、分类整理、阅读批注以及论文引用管理，大幅提升科研效率。

今天就带大家从零开始了解 Zotero 的使用方法。

一、Zotero是什么？

Zotero 是一款免费的开源文献管理软件，可以理解为科研人员的“电子文献数据库”。它不仅可以保存论文 PDF 文件，还能够自动获取文章的标题、作者、期刊名称、发表年份、DOI、摘要信息以及关键词等重要信息。

同时，Zotero 可以与 Word 等写作软件连接，实现论文写作过程中的自动引用和参考文献生成。

以前的参考文献管理：

下载文献 → 修改文件名 → 建Excel表格记录 → 手动插入参考文献

使用Zotero后的参考文献管理：

浏览器收藏 → Zotero自动整理 → 写论文一键引用

二、Zotero下载安装

Zotero 官方提供 Windows、macOS 和 Linux 等多个版本。

官网链接：

https://www.zotero.org/

安装主要包括两个部分：

1. 安装 Zotero 软件

下载安装 Zotero 主程序后，可以直接打开使用。

2. 安装浏览器插件

Zotero Connector 是非常重要的浏览器插件。

它可以帮助科研人员在浏览网页、数据库检索论文时，一键保存文献。

支持 Chrome、Edge、Firefox 等常用浏览器。

例如，在 PubMed、Web of Science 或期刊官网搜索论文时，浏览器右上角会出现 Zotero 图标。

点击后，论文标题、作者、期刊信息以及 PDF 文件都会自动保存到 Zotero 中。

三、Zotero界面认识

第一次打开 Zotero，主要分为三个区域。

1. 左侧：文献分类区域

这里类似电脑中的文件夹，可以根据研究方向建立不同分类。

例如：

肿瘤研究

类器官

动物模型

单细胞测序

课题相关文献

建议不要把所有论文都堆积在“我的文库”中。提前做好分类，可以提高后期查找效率。

2. 中间：文献列表区域

这里显示所有保存的文章。

可以查看：

标题

作者

年份

期刊

标签

还可以按照年份、作者、添加时间等方式进行排序。

3. 右侧：详细信息区域

点击某篇论文后，可以查看：

文献信息

PDF附件

标签

笔记

相关链接

如果文章信息不完整，也可以手动修改。

四、如何添加第一篇文献？

Zotero 添加文献主要有三种方式。

方法1：浏览器一键保存（推荐）

例如搜索一篇论文：

打开论文页面后，点击浏览器中的 Zotero 图标。

Zotero 会自动识别：

标题

作者

期刊

DOI

同时下载对应 PDF 文件。

这是科研人员最常使用的方法。

方法2：导入PDF自动识别

如果电脑中已经保存大量 PDF 文件，可以直接拖入 Zotero。

Zotero 会尝试通过 DOI 自动识别论文信息。

例如：

原始文件：

Nature_2025_organoid.pdf

导入后可能自动转换为：

Smith et al.

Organoid models for cancer research

Nature, 2025

这样可以避免手动修改大量文件名称。

方法3：通过 DOI 添加

如果知道论文 DOI：

点击：

文件 → 从标识符添加条目

输入 DOI 后，Zotero 会自动获取完整论文信息。

五、如何整理大量文献？

当文献数量达到几百篇甚至上千篇时，合理整理非常重要。

推荐使用以下方式：

1. 文件夹分类

例如：

我的文库

├── 肿瘤

├── 免疫

├── 类器官

├── 动物模型

└── 实验方法

按照研究方向分类，可以快速定位相关文献。

2. 使用标签管理

标签相比文件夹更加灵活。

例如：

已阅读

重点关注

实验方法

可能引用

高影响因子

通过标签，可以快速筛选符合条件的文章。

3. 添加个人笔记

阅读论文时，不建议只收藏 PDF。

可以在 Zotero 中记录：

研究目的

核心方法

关键结果

实验设计思路

例如：

“该文章建立了XXX动物模型，可参考其造模方法。”

几年后再次查看时，可以快速回忆文章内容。

六、如何使用Zotero阅读和批注论文？

Zotero 新版本支持 PDF 阅读功能。

打开论文后，可以：

高亮重点内容

添加文字批注

添加标签

建立笔记

例如：

黄色标记：

重要实验方法

蓝色标记：

关键研究结果

红色标记：

需要进一步研究的问题

这些批注都会保存在对应文献中，方便后续整理。

七、Zotero如何插入论文参考文献？

这是科研人员最关注的功能。

1. 安装Word插件

安装 Zotero 后，Word 中会自动出现 Zotero 工具栏。

主要功能包括：

Add/Edit Citation（插入引用）

Add/Edit Bibliography（生成参考文献）

Document Preferences（修改引用格式）

2. 插入引用

写论文时：

例如：

“近年来，类器官技术在疾病模型研究中快速发展。”

将光标放在句子后方。

点击 Add/Edit Citation。

搜索对应论文。

选择后，引用会自动插入。

3. 自动生成参考文献

论文完成后：

点击 Add/Edit Bibliography。

Zotero 会自动生成完整参考文献列表。

如果投稿期刊要求改变格式：

只需要修改引用样式即可。

例如：

Nature格式

Cell格式

Frontiers格式

无需重新手动调整。

八、科研人员常用Zotero插件推荐

1. Better Notes

增强笔记功能。

适合整理：

文献总结

研究思路

课题方案

2. Zotero PDF Translate

论文阅读辅助插件。

支持：

PDF划词翻译

全文翻译

对于英文文献阅读非常方便。

3. Zotero Better BibTex

适合使用 LaTeX 或 Overleaf 写论文的科研人员。

可以更方便地管理参考文献。

九、新手使用Zotero常见问题

Q1：PDF保存后没有作者信息？

解决：

右键点击文献，选择“从PDF获取元数据”。

Q2：换电脑后文献怎么办？

可以使用 Zotero 同步功能。

同步内容包括：

文献记录

标签

笔记

PDF附件可以根据个人需求选择同步方式。

Q3：文献太多会不会混乱？

所以建议从开始使用 Zotero 时就建立规范。不要下载几百篇论文全部放在一个文件夹。养成阅读前分类，阅读后记录的好习惯。

十、科研人员应该尽早 使用Zotero

科研效率提升，很多时候并不是依靠更长时间工作，而是依靠更合理的方法和工具。

Zotero 最大的价值，不只是保存论文，而是帮助科研人员建立属于自己的知识管理体系。

今天阅读的一篇论文，

半年后的实验设计，

一年后的论文写作，

都可以通过 Z otero 建立联系。

对于刚进入科研阶段的学生来说，越早养成规范的文献管理习惯，后期进行课题研究、论文写作和文献综述都会更加高效。

从今天开始，把你的文献管理从“文件夹时代”升级到 Zotero 时代。

你目前是如何管理科研文献的？

Excel记录？

文件夹分类？

还是已经开始使用 Zotero？

欢迎留言交流。