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研究背景
深静脉血栓(DVT)是创伤后导致发病和死亡的关键因素之一,常引发血栓后综合征、复发性DVT,甚至致命性肺栓塞(PE)等严重并发症。在创伤患者中,由于损伤类型、术后或伤后制动等因素影响,DVT 的发生风险显著升高,因此创伤后深静脉血栓(pt-DVT)长期被视为成人创伤人群中的核心临床难题。从公共卫生角度来看,中国创伤性骨折患者中pt-DVT的发生率可高达40%,这一比例凸显出pt-DVT对我国公共健康的严重威胁,迫切需要开展针对性研究以降低疾病负担。
2024年9月,Nature Communications 在线发表了题为 “Integrated landscape of plasma metabolism and proteome of patients with post-traumatic deep vein thrombosis” 的研究。该研究纳入680例急性创伤骨折患者,结合血浆非靶向代谢组学与蛋白质组学分析,并应用支持向量机(SVM)构建预测模型。研究最终筛选出28个与pt-DVT相关的差异代谢物和14个临床参数,揭示了17条显著失调的代谢通路,鉴定出214个差异血浆蛋白,并建立了由9个代谢物组成的高效能pt-DVT预测模型。进一步的代谢组与蛋白质组联合分析提出了潜在机制:糖酵解/糖异生—TCA循环的上调通过调控红细胞内ROS水平促进血栓形成。同时,研究还发现炎症因子CRP与pt-DVT相关代谢物及临床参数存在显著关联。
研究结果
1、研究队列的临床特征
本研究依照严格的纳入与排除标准,共招募680例患者,分为发现队列(N = 580)与验证队列(N = 100)。在发现队列中,确诊pt-DVT的患者252例作为病例组,另有328例无DVT患者作为对照组。与此同时,研究团队按照相同的招募标准,额外选取50例pt-DVT患者及50例无DVT患者,构建独立验证队列。整体分析结果显示,pt-DVT组与对照组在基线临床特征上分布大体均衡。
2、全球血浆代谢特征以及pt-DVT中改变的代谢物组
研究从代谢物功能分类、差异代谢物筛选、分组区分效能、关键代谢物贡献度及差异代谢物聚类五个维度展开展示。
首先,基于326个稳定代谢物的功能分类结果,饼图显示脂质与氨基酸类占比最高,提示其在代谢重构中的主导地位。其次,通过火山图对差异代谢物进行可视化,标注出前10个显著升高及降低的代谢物,明确了潜在的标志物线索。OPLS-DA得分图进一步表明,pt-DVT组与对照组在整体代谢谱层面呈现清晰的聚类分离,且模型验证显示无过拟合,增强了分析的可靠性。在变量重要性评估(VIP)分析中,共筛选出96个对分组区分贡献显著的代谢物,其中红色点代表在单变量和多变量分析中均显著的代谢物,突出其稳健性与代表性。最终,热图展示了28个确认的显著差异代谢物在两组样本中的丰度变化,这些代谢物不仅能够完全区分两组个体,而且同类代谢物表现出一致的变化趋势。
整体来看,分析过程从功能分类到差异筛选,再到分组效能验证、贡献度量化与聚类整合,逐步收敛至核心差异代谢物,构建了pt-DVT代谢异常的系统性图景。
3、与pt-DVT相关的多种代谢途径失调
去偏稀疏偏相关(DSPC)网络分析揭示了代谢物之间显著的部分相关关系。拓扑结构显示,不仅功能代谢物组间存在密切联系,组内也形成了高度互作网络,其中尤以脂质代谢与氨基酸代谢之间的相互作用最为突出。此外,部分未知功能代谢物紧密邻近脂质、氨基酸及丙酮酸等关键节点,提示其可能参与相关代谢过程。
在通路层面,共有307种代谢物成功映射至52条KEGG通路,其中17条通路呈现显著失调,主要涉及氨基酸代谢、碳水化合物代谢及脂质代谢,显示pt-DVT患者存在大规模代谢紊乱。进一步的差异丰度(DA)评分结果表明:6条氨基酸代谢通路和5条碳水化合物代谢通路(包括糖酵解/糖异生及TCA循环)整体活性升高,而3条脂质代谢通路则表现为活性下降。同时,研究还发现如半胱氨酸–蛋氨酸代谢等与pt-DVT传统认知中关联较弱的氨基酸代谢通路亦存在异常。
综上,DSPC网络与通路分析不仅揭示了pt-DVT患者多维度的代谢通路失调,还展示了代谢物之间复杂而有层次的网络关系,为深入解析其代谢机制提供了系统性依据。
4、pt-DVT 相关的临床参数差异及其与代谢物的关联
单变量分析火山图共筛选出14个显著差异临床参数(CPs),其中5项在pt-DVT组升高(如纤维蛋白原Fbg、血小板计数PLT),9项降低(如红细胞计数RBC、血红蛋白HGB)。皮尔逊相关性矩阵进一步揭示,这些参数倾向于形成功能相关的集群:一类为“升高的PLT-PCT-Fbg集群”,另一类为“降低的RBC-HCT-HGB集群”。
线性回归模型对临床参数与代谢物的关系进行解析,结果显示PLT集群与16个代谢物显著相关(如丙酰肉碱、L-肉碱),RBC集群则与15个代谢物显著相关(如咪唑乙酸、丙酮酸)。进一步的定量富集分析表明,PLT集群相关代谢物主要集中于8条脂质代谢通路,尤其是脂肪酸氧化;而RBC集群相关代谢物则映射至26条通路,涵盖氨基酸、碳水化合物及脂质代谢,包括糖酵解/糖异生和TCA循环等核心能量代谢途径。
整体上,研究不仅构建了pt-DVT的临床参数集群框架,还揭示了这些集群与代谢物及其通路之间的紧密耦合关系,提示临床指标的异常可通过代谢网络得到解释与支持,为理解pt-DVT的系统性病理机制提供了关键证据。
5、机器学习识别血红素代谢阻滞以鉴别pt-DVT
为验证预测模型的泛化能力,对独立验证队列中的100名参与者进行了代谢组学分析。结果显示3个预测模型(仅临床参数 CPs 的 Model 1、仅代谢物的 Model 2、CPs + 代谢物的 Model 3)在发现队列和验证队列的 ROC 曲线及 AUC 值,结果显示 Model 1 效能最差(发现队列 AUC=0.873,验证队列 AUC=0.857),Model 2 效能最优(发现队列 AUC=0.956,验证队列 AUC=0.935),Model 3 效能介于两者之间(发现队列 AUC=0.935,验证队列 AUC=0.910);箱线图与小提琴图展示了 Model 2 中 9 个关键代谢物(十六烷二酸、丙酮酸、L - 肉碱、血清素、PE (P18:1 (11Z)/18:2 (9Z,12Z))、3 - 羟基癸酸、5,6-DHET、3 - 甲氧基苯丙酸、戊腈)在 pt-DVT 组与对照组的相对丰度差异,进一步验证了这些代谢物对 pt-DVT 的区分能力,整体表明 “仅用 9 个代谢物构建的 Model 2” 在 pt-DVT 预测中具有最优的效能和泛化能力。
6、代谢组学和蛋白质组学分析揭示了pt-DVT的潜在治疗策略
为进一步解析pt-DVT的代谢机制,本研究在发现队列中选取96名患者与87名对照个体,开展了全面的血浆蛋白质组学分析。火山图筛选出214个显著差异蛋白,其中153个在pt-DVT组上调,61个下调,并重点标注了前40个变化幅度最大的蛋白。KEGG通路富集结果显示,这些差异蛋白显著集中于15条通路,其中补体与凝血级联通路为最显著失调的通路,同时糖酵解/糖异生通路亦被显著富集。值得注意的是,结合代谢组与蛋白质组的联合结果发现,糖酵解/糖异生通路在代谢物与蛋白质层面均呈系统性改变,该通路通过丙酮酸与三羧酸循环直接衔接,提示其在pt-DVT代谢异常中的核心地位。
进一步聚焦糖酵解/糖异生与TCA循环,研究通过通路可视化揭示了关键分子水平的改变。结果显示,从“葡萄糖-6-磷酸”至“丙酮酸”的关键步骤,以及TCA循环中“丙酮酸→柠檬酸”的起始环节,均存在显著的分子变化。具体而言,甘油醛-3-磷酸、磷酸烯醇式丙酮酸等代谢物以及葡萄糖磷酸异构酶(GPI)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、乳酸脱氢酶(LDHA/LDHB)、丙酮酸激酶(PKM)等关键酶均被标注并分析。可视化结果中,红色表示pt-DVT组相对于对照组的显著上调,蓝色为下调,黑色为无显著差异,灰色节点则标识未检测到的蛋白质,以确保数据透明性。结果显示丙酮酸、柠檬酸显著升高,糖酵解/糖异生通路中8个核心酶(LDHA、LDHB、GAPDH、GPI、PKM、MINPP1、ENO1、TPI1)均显著上调。
结合代谢与蛋白质层面的系统性证据,研究进一步提出“糖酵解/糖异生-TCA循环→NADH→ROS”的逻辑链。差异蛋白(如LDHA/LDHB)与ROS相关蛋白PRDX5呈显著关联,提示糖酵解/糖异生及TCA循环的上调,可能通过增强NADH生成、促进红细胞内ROS水平升高,从而驱动血栓形成。这一机制整合不仅揭示了pt-DVT的分子病理基础,也为后续干预靶点的探索提供了方向。
结论
本研究基于“发现—验证”双队列设计,共纳入680例急性创伤骨折患者(发现队列580例,验证队列100例)。研究通过血浆非靶向代谢组学与蛋白质组学分析,结合全自动凝血分析仪与血液分析仪检测临床参数,并应用主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)、去偏稀疏偏相关(DSPC)网络等多维度方法开展系统解析。
最终,研究鉴定出28个与pt-DVT显著相关的差异代谢物和14个差异临床参数,其中可进一步归纳为“升高的PLT-PCT-Fbg集群”与“降低的RBC-HCT-HGB集群”。通路分析显示,共有17条代谢通路发生显著失调,其中糖酵解/糖异生—TCA循环的整体上调与脂质代谢的下调为核心特征。基于代谢物信息,研究成功构建并验证了由9个代谢物组成的高效预测模型,表现出优异的区分能力与泛化性能。
在机制层面,代谢组学与蛋白质组学的联合分析揭示:糖酵解/糖异生—TCA循环的上调可通过增加NADH生成,促进红细胞内ROS蓄积,从而增强血栓形成倾向。这一结果不仅为pt-DVT的分子机制提供了新证据,也为临床早期预测与干预提供了潜在靶点。
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